אבנים לפסיפסי קיר בגוונים שונים, מזכוכית שקופה ואטומה ומזכוכית מוזהבת, ונטיפה מאם-הפנינה. פסיפסי קיר מזכוכית עם שיבוצי אם-הפנינה עיטרו משטחים רבים במבני הר הבית. חלקם, במיוחד בפן החיצוני של כיפת הסלע, הוחלפו במאה ה-16 בפקודתו של הסולטן סולימן המפואר באריחים מזוגגים מצויירים. פסיפס זכוכית רחב מידות מעטר עדיין את קירותיו הפנימיים של מבנה כיפת הסלע. ניתן לשער שמרבית אבני הפסיפס שבידינו מקורם בפסיפסים המקוריים של כיפת הסלע, מהמאה ה-8, שהוסרו בעת ההחלפה לאריחים בראשית התקופה העות’מאנית.